根据教育部《关于开展第二轮“双一流”建设中期自评工作的通知》要求，学校党政高度重视，在学校“双一流”建设领导小组的统一部署下，组织制定中期自评工作方案，组建中期自评工作专班，持续推进中期自评工作。
6月12日上午，学校召开中期自评工作部署会，对“双一流”建设中期自评工作任务进行安排部署。党委书记李旭锋强调，学校各相关部门要高度重视此次中期自评工作，要将相关工作落实落细。要提高思想认识，坚持问题导向，加强统筹协调，压实工作责任。自评结果要全面真实地反映学校“双一流”建设情况，做到以评促改、以评促建、以评增效。
本次中期自评工作充分发挥专家咨询作用，组织校内外专家评议，专家总体肯定了学校第二轮“双一流”建设以来取得的成效，对下一步建设提出了宝贵建议。
7月6日上午，校长张卫国主持召开西南大学“双一流”建设领导小组2023年第1次会议，评议学校整体建设自评报告和教育学、生物学学科的建设自评报告。张卫国对建设中期取得的成效给予了肯定，强调要按照“双一流”建设方案、深化新时代教育评价改革重点任务、服务国家重大战略和区域经济社会发展、解决“卡脖子”问题等方面完善自评报告。
7月10日上午，生物学一流学科建设工作组和教育学一流学科工作组分别就两个一流学科自评报告进行专题讨论，会议由发展规划与学科建设部主要负责人主持，副校长王进军参加生物学工作组专题讨论，提出优化建议和进度要求。
7月14日上午，副校长葛信勇召集发展规划与学科建设部和相关人员进一步讨论完善学校整体建设自评报告和两个一流学科建设自评报告。葛信勇对三份自评报告提出进一步完善建议。
学校第二轮“双一流”建设中期自评报告进一步完善后，经学校审定上报。通过本次自评工作，全面检视学校“双一流”建设成效，针对自评中发现的问题，进一步优化建设举措，提升“双一流”建设水平，增强学科核心竞争力和服务国家重大战略需求的能力，为学校向研究型大学转型贡献学科力量。